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      circRNA

      標準化分析 > RNA測序 > circRNA測序 > circRNA

       circRNA測序
      環狀RNA(circRNA)是一類特殊的非編碼RNA分子,與傳統的線性RNA(linear RNA)不同,circRNA分子合呈封閉環狀結構,且不受RNA外切酶影響,表達更穩定,不易降解。環狀RNA測序能夠進行環狀RNA的鑒定以及環狀RNA與miRNA海綿效應分析, 可實現ceRNA(源競爭RNA)機制等研究。
      技術優勢
      方法靈活:可以使用去核糖體建庫測序數據分析環狀RNA;
      結果可靠:采用多種軟件對環狀RNA進行鑒定和預測;
      實驗嚴謹:R酶建庫方法穩定,去除線性RNA效率高;
      分析經驗豐富:完成了數千份數據的分析。
      產品應用



      信息分析內容
      一、標準信息分析
            1. 基本數據統計
              1.1去除接頭序列、低質量序列得到clean data
              1.2與核糖體數據庫比對,去除核糖體RNA數據
            2. 環狀RNA預測鑒定
            3. 環狀RNA所在線性基因注釋
            4. 環狀RNA在基因組上的定位
            5. 環狀RNA表達定量分析
            6. 樣品(組)間表達差異分析
      二、高級信息分析
            1. 差異環狀RNA來源的基因GO功能及富集分析
            2. 差異環狀RNA來源的基因Pathway功能及富集分析
            3. 環狀RNA與miRNA互作分析(適用于人/小鼠物種)
       
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